Первая община мусульман в Хакасии возникла на закате СССР. Инициатором и основателем ее стал предприниматель Джунайдулло Насруллаев, таджик из Узбекистана, с 70-х годов проживавший в столице региона городе Абакане.

На стадии становления джума-намазы для небольшой общины проводились в доме Д.Насруллаева. В период развала СССР и с утратой коммунистами монополии на идеологию, в республиканской газете «Хакас чири» отдельные активисты хакасского национального движения «Тун» рассматривали ислам в качестве основы для морального и экономического подъема коренного тюркского народа*, представителей которого в дореволюционных источниках именовали енисейскими, абаканскими татарами.

В 90-е годы численность мусульман в Хакасии резко возросла в связи с миграцией из республик Средней Азии и Кавказа. Значительное количество приверженцев ислама работало на рынке, обеспечивая республику овощами и фруктами с родины, что и предопределило появление первой неофициальной мечети на территории Центрального рынка. Под мечеть глава общины мусульман Джанайдулло Насруллаев передал один из этажей принадлежащего ему трехэтажного здания на территории рынка. В этом же строении разместилось «халяльное» кафе «Восток».

В 1999 году, в период создания Духовного управления мусульман Азиатской части России, община мусульман Абакана вошла в состав новой централизованной структуры. Джунайдулло Насруллаев возглавил Саянский казыят ДУМАЧР, который по замыслу должен был объединить мусульманские организации Абакана, Черногорска (Хакасия), Кызыла (Тувы) и Минусинска (Красноярский край).

С начала 90-х годов Д.Насруллаев не раз обращался в городскую администрацию с просьбой предоставить участок для строительства мечети. Мэрия не отказывала, однако предлагаемые земли в пригороде, где не было ни инженерных коммуникаций, не устроили актив мусульманской организации. Чтобы заслужить доверие горожан, ставших жертвами антиисламской информационной кампании в СМИ в период «чеченских войн», предприимчивый глава общины мусульман основал таджикско-узбекский культурный центр Абакана, который активно включился в общественную и культурную жизнь города.

В 2006 году мэрия Абакана выделила участок 750 кв.м под мечеть в центральной части города на улице Торосова, 1. К тому времени Джунайдулло Насруллаев стал мухтасибом Саянского казыята, председателем Абаканской организации мусульман был избран Халим Хамракулов, математик, в прошлом преподаватель университета в Таджикистане.

В конце нулевых годов спокойную, размеренную жизнь мусульман Абакана разрушило появление в регионе православного религиоведа Романа Силантьева. За два приезда в Хакасию Р.Силантьев сумел резко отрицательно настроить руководство региона и города к структуре ДУМАЧР и Совету муфтиев России. В результате давления община мусульман Абакана была вынуждена в 2009 году выйти из состава прежней централизованной организации и войти в состав ЦДУМ, опасаясь ликвидации общины и изъятия земельного участка.

В 2010 году председателем новой организации «Махалля г. Абакан» стал предприниматель Дильмурад Хушваков. В настоящее время джума-намазы под руководством имама Хабибуллы Турсунова проводятся во временном молитвенном доме, возведенном на выделенном для строительства мечети участке на улице Торосова. По замыслу правления организации первая мечеть «Ал-Куддус» г. Абакан будет одной из крупных и красивых в Восточной Сибири.

В Хакасии также с 2003 года действует официальная организация мусульман в городе Черногорск, она входит в состав ДУМ Сибири Омского муфтията.

*Чистогашев Н. Будет ли у нас мечеть. «Мусульмане Сибири», № 13 (14) февраль 2001 г.