Мусульманское религиозное объединение города Костромы создано 20 апреля 1992 года в юрисдикции ДУМЕР. Первым председателем стал М.Х.Хайрутдинов, в 1994-2012 гг. председателем был Хасан Салихович Зарипов, с 2012 г. -  Гумеров Флун Фагимович. с 2000 года имам общины - Марат-хазрат Жалялетдинов.

В 1995 году городская администрация предоставила общине здание бывшего клуба фабрики «Ременная тесьма», где разместилось момельное помещение. В 1998 году решением городской Думы Костромы здание безвозмездно передано в собственность МРО. В 1999 году в Костроме стала издаваться газета «Ислам». В 2003 году началось строительство Мемориальной мечети в честь мусульман, погибших во время Великой Отечественной войны в Костроме.

МРО г. Костромы осуществляет кураторство над религиозной деятельностью другиз мусульманских религиозных объединений области - МРО "Религиозное общество мусульман Нерехтского района Костромской области" и МРО "Мусульманское религиозное общество г.Галича".

Официальный сайт общины - http://islam44.com.