Централизованная религиозная организация «Духовное управление мусульман Азиатской части России» была учреждена в 1997 году в Тобольске, тогда она носила название «Духовное управление мусульман Сибири и Дальнего Востока». В феврале 1999 г. ДУМ Сибири и Дальнего Востока было преобразовано в Духовное управление мусульман Азиатской части России (ДУМАЧР). Председателем с момента учреждения является Нафигулла Аширов.

Под его каноническим управлением, в 25 субъектах РФ, действуют 28 региональных духовных, казыятских управлений, более 270 местных религиозных организаций и 170 религиозных групп. Для упорядочения деятельности местных религиозных организаций, оказания им помощи на местах, созданы и активно работают в областях и республиках Азиатской части России региональные духовные и казыятские  управления ДУМАЧР.

Видные религиозные деятели в структуре ДУМ АЧР: муфтий по Уральскому региона – Данис Давлетов, муфтий по Сибирскому региону Анарбек Жунусов, муфтий по Дальневосточному региону – Абдулла Дамир Ишмухамедов, руководитель Комитета по образованию и науке, по защите прав мусульман – Илхом Меражов и др.

Головной офис ДУМ АЧР располагается в Москве.